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5 个月前

IntFold:一种可控的基础模型用于通用和专业的生物分子结构预测

The IntFold Team Leon Qiao Wayne Bai He Yan Gary Liu Nova Xi Xiang Zhang

IntFold:一种可控的基础模型用于通用和专业的生物分子结构预测

摘要

我们介绍了IntFold,这是一种可控的基础模型,适用于一般性和专业性的生物分子结构预测。IntFold展示了与最先进的AlphaFold3相当的预测准确性,同时采用了更为优越的定制注意力内核(customized attention kernel)。除了标准的结构预测外,IntFold还可以通过使用单独的适配器来预测别构状态、约束结构和结合亲和力。此外,我们引入了一种新的置信度评估模块,用于估计对接质量,为抗体-抗原复合物等具有挑战性的目标提供更加细致的评估。最后,我们分享了在训练这一计算密集型模型过程中获得的见解。

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